Vimでいろいろやるために環境整備。 まずgitのインストール $ brew install git $ brew update (homebrewのアップデートにはgitが必要らしい） $ cd ~/.vim $ sudo git clone https://github.com/tpope/vim-pathogen.git 作成されたvim-pathogenフォルダ内の…

Twitter-Bootstrapをはてなブログで試してみた。 Twitter-BootstrapのCSSをはてなブログのCSSにコピーして JavaScriptをDropboxに入れて試した。 左 右 左右のカラムでわかれるはずがうまく行かない。 Javascriptかなあ。よくわからない。

Macのパスを通す方法。 bashの部分書き換えればUNIX系なら概ね同じだろうと思うけど。 よく忘れるのでメモ。 $ cd # .bash_profileがあることを確認 $ ls -a $vi .bash_profile # .bash_profileの中に下記を記載 PATH=/usr/local/mysql/bin:$PATH:/Applicati…

DjangoのO/Rマッパーに頼ると他で使えず困りそう。 そこで、より汎用的な（気がする）SQLalchmyに移行（したい）。 from sqlalchemy import create_engine engine = create_engine('mysql://ユーザー名:パスワード@localhost/column_db', echo=True) #echo=T…

続き。 C:\HPLC_database\column\column>django-admin.py startapp data_app C:\HPLC_database\column\columnにdata_appフォルダが出来る。 C:\HPLC_database\column\columnフォルダの INSTALLED_APPS に下の行を追加して、data_appのアプリを認識させる 'co…

フォルダを作って移動してC:\HPLC_database>django-admin.py startproject ColumnC:\HPLC_database\column>python manage.py runserverブラウザでhttp://127.0.0.1:8000/起動を確認。MySQLのユーザー追加#全権ユーザーの追加mysql> GRANT ALL ON *.* TO ユー…

HomebrewにするとMeCab-pythonがダメなので一から入れなおした。 http://mecab.googlecode.com/svn/trunk/mecab/doc/index.html#download ここで ・mecab-0.994.tar.gz ・mecab-ipadic-2.7.0-20070801.tar.gz http://code.google.com/p/mecab/downloads/list…

Macportsで入れたMySQL5.5がまともに動かない上に、 一度入れるとMySQL5.1も導入できなくなった。 そこでHomebrewに移動することに。 Homebrewのインストール ruby <(curl -fsSkL raw.github.com/mxcl/homebrew/go) PHP、MySQLはこれで入れた http://www.mam…

Macには元々Mysqlが入っているが扱いづらい。 MacportsでMySQL5.5を新たに入れたは良いけど、優先順位が低くなっている。 そこでMacportsの優先順位付け機能を使用する。 $ sudo port select --list mysql Available versions for mysql: mysql55 none (acti…

Rとpythonを連携させてみる。 まずはpython import sys a = sys.argv[1] b = a * a f = open("test.txt","a+") f.write("str(b)") f.close これをtest.py等、なんでも良いので保存 （test.txtがあること前提。無いなら"a+"→"w"へ） 続いてR >Z <- 10 >cmd <-…

Rでクロマトグラム（SEC)の数理解析をする計画その① SEC（サイズ排除クロマトグラフィー）について http://www.shodex.com/japanese/kouzad.html 実データだと予備検討が難しいのでモデルデータを作る。 # X軸用 > x <- seq(0,20,0.05) # 最大排除限界の異な…

テーブルデータはRだと取り扱いは簡単。 (データフレーム） Pythonはどうなんだろうと思って調べてみた。 http://omoplatta.blogspot.jp/2010/07/unixlinux.html ……えらい面倒だ。 実験データ程度で多変量や統計解析するなら Rのが楽という状況は変わらない…

基本はここの通り http://blog.happadd.com/?p=153 違う所のみ記載 apacheの旧バージョンから移行するためパスを通す $ export PATH=/opt/local/apache2/bin/:$PATH PHPとの関連付け後apacheを再起動。 httpdの再起動も併せて実施。 $ sudo apachectl restar…

データの出し入れ目的でpythonとMysqlをバインディング。 #pythonとmysqlのバインディング #（mysqlも同時にインストール) $sudo port install py27-mysql $sudo port install mysql-server #データベースの初期化 $sudo -u _mysql mysql_install_db5 以下コ…

pythonで処理ファイルのパス指定が面倒。 自分で動いてみる。 import os #カレントディレクトリの確認 os.getcwd() #ディレクトリの移動os.chdir('/') ここから追記 Windowsの場合 os.chdir('c:¥¥Document and Settings¥¥test') のように￥マークが２つ必要…

ダイアリーからこちらに移動。 まだ殆ど書いていないけど。

処理ファイルのパス指定が面倒なので import os #カレントディレクトリの確認 os.getcwd() #ディレクトリの移動 os.chdir('/')参考 http://abalone.ununu.org/archives/598

昨日のKanScipyで一瞬名前の出たipythonのnotebookを使ってみた。参考（というかほぼそのまま） http://d.hatena.ne.jp/inoshirou/20111219/1324313733ipythonはMacportsで入れたものを使用。 $ ipython notebook 動かない。tornadoを入れろとか。 $ sudo pi…

機械学習ライブラリscikit-learnのインストール sudo pip install scikit-learn ここのサンプル通りにやって…… http://scikit-learn.org/stable/auto_examples/gaussian_process/plot_gp_regression.htmlこんな感じ 目的を持って学ぶ必要がありそう。

形態素解析のMeCabをMacに入れる。 pythonとバインディングまで。Macportsを使用。 $ sudo port install mecab $ sudo port install mecab-ipadic-utf8 $ sudo port install py27-MeCab$ sudo vi /opt/local/etc/mecabrcdicdir = /opt/local/lib/mecab/dic/i…

Macportsのアップデート $ sudo port selfupdateアプリを全てアップデート $ sudo port upgrade outdated指定のアプリをアップデート $ sudo port upgrade opencvインストール済みソフト一覧 $ sudo port installed 以前のバージョンは残るのでアンインスト…